La principale différence entre les vecteurs d'insertion et de remplacement est que le vecteur d'insertion a la capacité d'insérer des longueurs modérées d'ADN étranger tandis que le vecteur de remplacement a la capacité de recevoir de plus grandes longueurs d'ADN étranger.
Les vecteurs phages sont les bactériophages utilisés pour le clonage. Il existe deux types de vecteurs phagiques; ils sont vecteur d'insertion et vecteur de remplacement. De plus, tous les vecteurs phagiques sont constitués de gènes non essentiels. Cependant, ces gènes doivent être retirés des phages pour faciliter de nouveaux inserts d'ADN étranger.
