Le différence clé entre les orbitales hybrides et dégénérées est que les orbitales hybrides sont de nouvelles orbitales qui se forment à partir du mélange de deux orbitales ou plus, alors que les orbitales dégénérées existent à l'origine dans un atome.
Comme son nom l'indique, une orbitale hybride est un hybride de deux orbitales ou plus. Bien que le nom orbital dégénéré semble le même, ce ne sont pas des orbitales nouvellement formées - elles existent déjà dans un atome. De plus, toutes les orbitales hybrides d'une molécule ont la même énergie tandis que les orbitales dégénérées d'un atome ont la même énergie.