La principale différence entre les macroalgues et les microalgues est que les macroalgues sont des organismes photosynthétiques aquatiques de grande taille et multicellulaires, tandis que les microalgues sont de petits organismes aquatiques photosynthétiques unicellulaires ressemblant à des plantes.
Les algues sont de grands organismes photosynthétiques polyphylétiques qui contiennent un groupe varié d'espèces. Elles vont des microalgues unicellulaires telles que la Chlorella aux macroalgues multicellulaires telles que le varech géant et les algues brunes. Ils sont pour la plupart de nature aquatique et autotrophe. Ils manquent de stomates, de xylème et de phloème, que l'on trouve dans les plantes terrestres.