La principale différence entre la prototropie et la tautomérie est que la prototropie traite de deux formes d'une molécule qui ne diffèrent l'une de l'autre que par la position d'un proton particulier, tandis que la tautomérie traite de l'interconversion de deux isomères structuraux via la relocalisation d'atomes ou de liaisons …
La prototropie est une forme de tautomérie; c'est la forme la plus courante de tautomérie. La tautomérie est un concept en chimie organique qui décrit la conversion d'un isomère structural en un autre isomère via la relocalisation d'atomes ou de liaisons. Si la délocalisation se produit dans un proton de la molécule, nous l'appelons prototropie. Par conséquent, ce type de tautomérie est connu sous le nom de tautomérie prototropique.