Différence clé - ADNc vs bibliothèque génomique
Il existe deux principaux types de bibliothèques d'ADN construites par des scientifiques utilisant des techniques de génie génétique. Ce sont la bibliothèque d'ADNc et la bibliothèque génomique. La principale différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique est que la bibliothèque d'ADNc contient l'ADN complémentaire cloné de l'ARNm total d'un organisme, tandis que la bibliothèque d'ADN génomique contient les fragments clonés du génome entier d'un organisme. La bibliothèque d'ADN génomique est plus grande que la bibliothèque d'ADNc.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la bibliothèque d'ADNc
3. Qu'est-ce que la bibliothèque génomique
4. Comparaison côte à côte - ADNc vs bibliothèque génomique
5. Résumé
Qu'est-ce qu'une bibliothèque génomique?
Une banque d'ADN génomique est une collection de clones portant les fragments d'ADN génomique total d'un organisme. Il contient tout l'ADN génomique de cet organisme, y compris les séquences codantes et non codantes. La construction d'une banque génomique est réalisée par la technologie de l'ADN recombinant suivie d'un clonage (génie génétique). Il y a différentes étapes impliquées dans la construction comme le montre la figure 01. Le processus commence par l'isolement d'ADN génomique. En utilisant un protocole d'extraction d'ADN approprié, l'ADN génomique total d'un organisme doit être isolé. Ensuite, l'ADN doit être converti en tailles gérables ou en fragments spécifiques par des endonucléases de restriction (enzymes coupant l'ADN). L'ADN fragmenté doit être inséré dans des vecteurs à l'aide d'ADN ligases (enzymes de jonction d'ADN). Un vecteur est un organisme auto-répliquant. Les plasmides et bactériophages sont des vecteurs couramment utilisés dans la technologie de l'ADN recombinant. Ces vecteurs ligaturés sont connus sous le nom de molécules d'ADN recombinant car ils portent à la fois des séquences d'ADN propres et insérées. Les vecteurs recombinants sont ajoutés à une bactérie hôte et amenés à absorber les vecteurs recombinants à l'intérieur de la cellule bactérienne. Les bactéries avec des vecteurs recombinants (plasmides) doivent être cultivées dans un milieu de culture. Au cours de la multiplication bactérienne, l'ADN bactérien, associé aux plasmides recombinants, réplique leurs génomes et produit des clones. Ces clones contiennent le génome entier de l'organisme source. Par conséquent, cela s'appelle une bibliothèque génomique. Les plasmides peuvent être facilement séparés de l'ADN chromosomique bactérien pour construire la bibliothèque génomique de cet organisme. Si un organisme particulier contient des gènes intéressés,il est facile de le détecter dans la banque génomique par hybridation à l'aide de sondes moléculaires (marqueurs).
Les bibliothèques génomiques sont importantes pour étudier la structure et la fonction génomique, les gènes spécifiques, la localisation des gènes, la cartographie génique, les mutations, le séquençage des gènes, l'identification de nouveaux gènes thérapeutiques, etc.
Figure_1: Construction d'une bibliothèque génomique
Qu'est-ce qu'une bibliothèque d'ADNc?
Une banque d'ADNc est une collection de clones d'ADN complémentaires (ADNc) synthétisés à partir d'ARNm total d'un organisme. La procédure de construction comporte différentes étapes. La purification de l'ARNm total d'un organisme est la première étape impliquée. Les ARNm isolés sont convertis en brins d'ADNc par un processus appelé transcription inverse. La transcription inverse est facilitée par une enzyme appelée transcriptase inverse. Il utilise une petite amorce 3 'et initie la synthèse du premier brin d'ADNc complémentaire du brin d'ARNm matrice. L'ADNc double brin résultant est converti en fragments plus petits en utilisant des endonucléases de restriction et inséré dans des vecteurs appropriés. Ces molécules recombinantes construites sont ensuite ajoutées dans un organisme hôte et cultivées dans un milieu de culture pour produire des clones. La collection de clones contenant des fragments d'ADNc d'un organisme est connue sous le nom de bibliothèque d'ADNc. L'ARNm mature entièrement tranché ne contient pas d'introns et de régions régulatrices. Par conséquent, les fragments non codants ne sont pas présents dans les bibliothèques d'ADNc contrairement à une bibliothèque génomique.
Les bibliothèques d'ADNc sont importantes pour l'analyse des régions codantes, des fonctions géniques, de l'expression des gènes, etc.
Figure_2: Construction d'une bibliothèque d'ADNc
Quelle est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique?
Diff article au milieu avant la table
ADNc vs bibliothèque génomique |
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| La bibliothèque d'ADNc est une collection de clones portant l'ADN complémentaire de l'ARNm d'un organisme | La bibliothèque génomique est une collection de clones portant l'ADN génomique total d'un organisme. |
| Codage vs séquences non codées | |
| La bibliothèque d'ADNc contient uniquement les séquences codantes; il ne contient pas d'introns. | La bibliothèque génomique comprend l'ensemble de l'ADN génomique, y compris l'ADN non codant (introns et régulateur). |
| Taille | |
| La bibliothèque d'ADNc est petite. | La bibliothèque génomique est grande. |
| Materiel de départ | |
| Le matériau de départ est l'ARNm | Le matériau de départ est l'ADN. |
| Implication de la transcription inverse. | |
| La transcription inverse se produit dans la première synthèse de brin d'ADNc. | La transcription inverse ne se produit pas. |
Résumé - ADNc et bibliothèque génomique
La banque génomique représente une population de clones portant l'ADN génomique total fragmenté d'un organisme. La banque d'ADNc représente la population de clones portant l'ADN complémentaire de l'ARNm total d'un organisme. Un clone d'ADNc contient uniquement les séquences trouvées dans l'ARNm tandis que le clone génomique contient les séquences du génome entier. C'est la différence entre l'ADNc et la bibliothèque génomique.
