La principale différence entre les micro-organismes aérobies et anaérobies est l'exigence d'oxygène pour les micro-organismes aérobies de survie, alors que ce n'est pas pour les micro-organismes anaérobies. C'est-à-dire que les micro-organismes aérobies ont besoin d'oxygène comme accepteur d'électrons final pendant la respiration aérobie, tandis que les micro-organismes anaérobies n'ont pas besoin d'oxygène pour leur respiration cellulaire.
La réponse à l'oxygène est la base de la classification des micro-organismes comme aérobies et anaérobies. Pour cette raison, ces micro-organismes possèdent des caractéristiques différentes pour remplir leurs fonctions pendant la respiration cellulaire. Par conséquent, les microbes aérobies subissent une respiration aérobie, tandis que les microbes anaérobies subissent une respiration anaérobie.
