La principale différence entre l'ester et l'éther est que le groupe fonctionnel d'un ester est -COO, tandis que le groupe fonctionnel d'un éther est -O-.
L'ester et l'éther sont des molécules organiques avec des atomes d'oxygène. Les esters ont le groupe -COO. Ici, un atome d'oxygène est lié au carbone par une double liaison et l'autre oxygène est lié par une simple liaison. Puisque seulement trois atomes se connectent à l'atome de carbone, il a une géométrie plane trigonale autour de lui. De plus, l'atome de carbone est hybridé sp 2. De plus, un ester est un dérivé d'acide carboxylique. Un éther, par contre, a un atome d'oxygène avec deux liaisons simples avec deux groupes alkyle ou aryle. L'atome d'oxygène a également deux paires d'électrons isolées.