La principale différence entre Pseudomonas aeruginosa et Pseudomonas fluorescens est que P. aeruginosa est un pathogène humain opportuniste tandis que P. fluorescens n'est pas un pathogène humain. Plus explicitement, P. aeruginosa est un pathogène des plantes et des animaux, y compris l'homme, tandis que P. fluorescence est une espèce bactérienne favorisant la croissance des plantes. Une autre différence importante entre Pseudomonas aeruginosa et Pseudomonas fluorescens est que P. aeruginosa a la capacité de se développer même à 42 ° C.
Pseudomonas est un genre bactérien qui comprend des bactéries flagellées à Gram négatif, en forme de bâtonnet et polaires. Ce sont des bactéries aérobies qui ne forment pas de spores, catalase positive et oxydase positive. De plus, ce genre comprend de nombreuses espèces dont P. aeruginosa, P. fluorescens, P. putida, P. syringae, etc.