La principale différence entre les champignons et les parasites est que les champignons sont un groupe d'organismes saprotrophes eucaryotes comprenant des levures, des moisissures et des champignons, tandis que les parasites sont un groupe d'organismes qui vivent sur ou à l'intérieur d'un autre organisme obtenant des nutriments.
Les champignons et les parasites provoquent diverses maladies chez les humains. Non seulement chez les humains, mais les parasites provoquent également des maladies chez d'autres animaux et plantes. Les parasites sont les organismes qui montrent un mode de vie appelé parasitisme. Le parasitisme est l'un des trois types de relations symbiotiques qui existent entre deux ou plusieurs espèces vivant ensemble. Certaines espèces de champignons, certains insectes, protozoaires et helminthes sont des exemples de parasites. Dans le parasitisme, les parasites vivent sur ou à l'intérieur d'un autre organisme appelé hôte; le parasitisme ne profite qu'au parasite tout en causant des maladies à son hôte. De plus, les parasites ne peuvent survivre sans leurs hôtes.