La principale différence entre les parasites et les bactéries est que les bactéries sont des procaryotes microscopiques unicellulaires vivant partout, tandis que les parasites sont les organismes qui vivent sur ou dans leurs hôtes tout en causant des infections aux hôtes.
Les parasites et les bactéries sont des organismes qui ressemblent à des organismes très primitifs mais qui ont de grandes adaptations pour survivre dans différentes conditions environnementales. Pour les humains, ces organismes sont primordiaux car la majorité des infections humaines sont causées par eux. Parfois, certaines bactéries sont considérées comme des parasites.