La principale différence entre la signalisation intracellulaire et intercellulaire est que la signalisation intracellulaire est la communication au sein de la cellule, tandis que la signalisation intercellulaire est la communication entre les cellules.
Les cellules libèrent des molécules de signalisation vers les cellules cibles et communiquent entre elles via des molécules de signalisation dans les organismes multicellulaires. Les cellules cibles ont des récepteurs sur leurs surfaces cellulaires et dans le cytoplasme pour recevoir des signaux et agir en conséquence. De plus, au sein de la cellule, une communication se produit entre les organites et le noyau pour exécuter les fonctions cellulaires. Par conséquent, il existe deux types de communication cellulaire: la signalisation ou la communication intracellulaire et la communication ou la signalisation intercellulaire.