La principale différence entre l'amarrage moléculaire et le scoring est que l'amarrage est une technique utilisée pour déterminer l'affinité de liaison entre deux molécules, tandis que le scoring est un processus d'évaluation d'une pose particulière en comptant le nombre d'interactions intermoléculaires favorables.
Les termes d'ancrage moléculaire et de notation sont utilisés dans le domaine de la modélisation moléculaire. La modélisation moléculaire est une technique utilisée pour déterminer les arrangements possibles de différentes molécules dans une substance donnée. Cette technique est importante dans la création de nouveaux composés stables.