Le différence clé entre les structures iso et néo est que le préfixe iso fait référence à un composé organique contenant tous les atomes de carbone sauf un formant une chaîne continue, tandis que le préfixe neo fait référence à un composé organique contenant tous les atomes de carbone sauf deux formant une chaîne continue.
Nous utilisons des préfixes en chimie organique afin de distinguer une molécule organique d'une autre. Nous utilisons ces préfixes avec le nom du composé. Étant donné que ces préfixes sont spécifiques de différents groupes fonctionnels dans les molécules organiques, nous pouvons facilement identifier les molécules organiques même si elles ont des structures chimiques étroitement liées.