La principale différence entre la carte génétique et la carte de liaison réside dans le type de gènes utilisés pour le processus de cartographie. La carte génétique comprend tous les gènes présents sur un chromosome particulier, tandis que la carte de liaison se compose de gènes liés présents sur un chromosome particulier.
La carte génétique et la carte de liaison sont deux types de cartes chromosomiques qui illustrent les gènes trouvés sur les chromosomes. Une carte génétique montre tous les gènes tandis qu'une carte de liaison ne montre que les gènes liés. Les deux sont très utiles pour diagnostiquer les maladies et les troubles génétiques. En outre, les aberrations chromosomiques peuvent également être détectées à l'aide de cartes génétiques et de liaison. Les cartes de liaison donnent en outre une idée de l'évolution de gènes particuliers.