La principale différence entre la disomie uniparentale et l'empreinte génomique est que la disomie uniparentale fait référence à plusieurs ensembles de processus tels que la réception de deux copies du chromosome ou d'une partie du chromosome tandis que l'empreinte génomique fait référence au processus où une copie du gène est inactivée.
La disomie uniparentale et l'empreinte génomique sont des occurrences rares qui se produisent au niveau moléculaire. Ces processus régulent l'expression des gènes chez les eucaryotes. De plus, ces processus jouent actuellement un rôle important dans le diagnostic des maladies et la génétique moléculaire.