La principale différence entre les euglénoïdes et les euglénoïdes est que les euglénoïdes sont un grand groupe d'organismes unicellulaires appartenant au royaume Protista, tandis qu'Euglena est le genre représentatif d'euglénoïdes le plus étudié.
Les euglénoïdes sont des organismes unicellulaires pour la plupart autotrophes. Ils appartiennent au royaume Protista et présentent à la fois des caractéristiques végétales et animales. Comme les plantes, ils photosynthétisent. Comme les animaux, ils bougent et changent de forme. De plus, ils ont deux flagelles; ce sont donc des organismes flagellés. Ils vivent principalement en eau douce, en particulier en eau riche en matière organique. Ils peuvent également vivre dans les eaux marines. Il existe 54 genres d'euglénoïdes dont Trypanosoma, Euglena et Eutreptia.