La principale différence entre BLAST et FastA est que le BLAST est un outil d'alignement de base disponible sur le site Web du National Center for Biotechnology Information, tandis que FastA est un outil de recherche de similitude disponible sur le site Web de l'European Bioinformatics Institute.
BLAST et FastA sont deux logiciels largement utilisés pour comparer des séquences biologiques d'ADN, d'acides aminés, de protéines et de nucléotides d'espèces différentes et rechercher leurs similitudes. Ces algorithmes ont été écrits en gardant à l'esprit la vitesse. Parce que, lorsque les scientifiques ont pu isoler l'ADN en laboratoire au milieu des années 1980, cela a soulevé le besoin de comparer et de trouver des gènes identiques pour des recherches plus poussées à grande vitesse. Par conséquent, ces deux logiciels ont été développés de manière à ce que l'utilisateur puisse effectuer une recherche rapide de séquences similaires avec celle de leurs séquences de requête.
BLAST est un acronyme pour Basic Local Alignment Search Tool et utilise l'approche localisée pour comparer les deux séquences. FastA est un logiciel faisant référence à Fast A où A signifie Tout. Ici, le logiciel fonctionne avec des alphabets comme Fast A pour le séquençage de l'ADN et Fast P pour les protéines. BLAST et FastA sont tous deux très rapides dans la comparaison de n'importe quelle base de données génomique et sont donc très viables financièrement et en gain de temps.
