La principale différence entre le DMSO et le MSM est que le DMSO est un composé organosulfuré qui existe en phase liquide, tandis que le MSM est un composé organosulfuré qui existe en phase solide.
Le terme DMSO signifie diméthylsulfoxyde tandis que le terme MSM signifie méthylsulfonylméthane. Ce sont tous deux des composés organosulfurés. Cela signifie; ces composés ont des atomes de soufre liés à des composés organiques. La principale différence entre le DMSO et le MSM réside dans la phase de la matière dans laquelle ces composés existent à température ambiante. Il existe également d'autres différences en plus de cette différence clé.