Le différence clé entre l'apodème et l'apophyse est que l'apodème est une invagination en forme de crête qui apparaît comme un sillon vers l'extérieur, tandis que l'apophyse est une invagination en forme de doigt trouvée dans l'exosquelette de l'insecte et visible sous la forme d'une minuscule fosse à l'extérieur.
Les arthropodes, y compris les insectes, ont un exosquelette, qui est une caractéristique déterminante de ce phylum. L'exosquelette est un squelette externe qui protège le corps de ces insectes. De plus, il offre une grande surface pour l'attachement musculaire. Par rapport à l'endosquelette des vertébrés, l'exosquelette offre une grande surface. Il y a des invaginations présentes sur l'exosquelette. Ce sont des excroissances internes de la cuticule. Ces invaginations augmentent encore la surface de fixation musculaire chez les insectes. De plus, ils améliorent la rigidité et la résistance de l'exosquelette.
Donc, en bref, l'apodème et l'apophyse sont deux types d'invaginations. Les invaginations en forme de crête sont des apodèmes tandis que les invaginations en forme de doigts sont des apophyses. Les deux types soutiennent les organes internes et augmentent également la surface de fixation des muscles.