Le différence clé entre le thiocyanate et l'isothiocyanate est que le thiocyanate est un groupe fonctionnel dans lequel le groupe alkyle ou aryle est lié via l'atome de soufre, tandis que l'isothiocyanate est l'isomère de liaison du thiocyanate dans lequel le groupe alkyle ou aryle est lié par l'atome d'azote.
Le thiocyanate et l'isothiocyanate sont des groupes fonctionnels contenant des atomes de carbone, d'azote et de soufre. Ces groupes fonctionnels ont la même connectivité d'atomes. Autrement dit, l'atome de carbone est au milieu, tandis que les atomes d'azote et de soufre sont attachés à ses côtés. Cependant, la liaison chimique entre ces atomes est différente les uns des autres.
