La principale différence entre les prostaglandines et les leucotriènes est que les prostaglandines sont produites par tous les types de cellules et toutes les parties du corps qui traitent des blessures et des maladies, tandis que les leucotriènes sont produits par les leucocytes.
Les eicosanoïdes sont une famille de médiateurs lipidiques bioactifs. Ce sont des acides gras oxygénés à 20 carbones synthétisés à partir d'acides gras essentiels alimentaires. Ils participent à la régulation d'un ensemble de réponses physiologiques et pathologiques. De plus, ils présentent de puissantes propriétés inflammatoires et aident au développement et à la régulation des réponses immunologiques et inflammatoires. Les prostaglandines et les leucotriènes sont deux types d'eicosanoïdes dérivés de l'acide arachidonique. Les prostaglandines renforcent les effets de perméabilité vasculaire de l'histamine et de la bradykinine tandis que les leucotriènes interviennent dans l'accumulation de leucocytes au cours d'une inflammation aiguë.