Différence clé - Réparation par excision de base vs réparation par excision nucléotidique
L'ADN est fréquemment soumis à des dommages dus à divers facteurs internes et externes. Cependant, les systèmes de réparation cellulaire corrigent immédiatement et constamment les dommages avant qu'ils ne deviennent des mutations ou avant qu'ils ne soient transférés aux générations suivantes. Il existe trois types de systèmes de réparation par excision dans les cellules: la réparation par excision des nucléotides (NER), la réparation par excision de base (BER) et la réparation des mésappariements d'ADN (MMR) pour réparer les dommages à l'ADN simple brin. Le différence clé entre la réparation par excision de base et la réparation par excision de nucléotides est que la réparation par excision de base est un système de réparation simple qui fonctionne dans les cellules pour réparer les dommages à un seul nucléotide causés de manière endogène, tandis que la réparation par excision de nucléotide est un système de réparation complexe qui fonctionne dans les cellules pour réparer comparativement des régions plus grandes et endommagées de manière exogène.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que la réparation par excision de base
3. Qu'est-ce que la réparation par excision de nucléotides
4. Comparaison côte à côte - Réparation par excision de base et réparation par excision de nucléotide
5. Résumé
Qu'est-ce que la réparation par excision de base?
La réparation par excision de base est la version la plus simple du système de réparation de l'ADN des cellules. Il est utilisé pour réparer des dommages mineurs dans l'ADN. Les bases d'ADN sont modifiées en raison de la désamination ou de l'alkylation. Lorsqu'il y a des dommages de base, l'ADN glycosylase reconnaît et active le système de réparation par excision de base et le récupère à l'aide des enzymes AP endonucléase, ADN polymérase et ADN ligase. Les étapes suivantes sont impliquées dans le système BER.
- Reconnaissance et élimination d'une base incorrecte ou endommagée par une ADN glycosylase pour créer un site abasique (sites de perte de base - sites apiuriniques ou apyrimidiniques).
- Incision du site abasique par une endonucléase apurinique / apyrimidinique
- Élimination du fragment de sucre restant par une lyase ou une phosphodiestérase
- Comblement des lacunes par une ADN polymérase
- Scellement de l'entaille par une ADN ligase
Figure 01: Voie de réparation par excision de base
Qu'est-ce que la réparation par excision nucléotidique?
La réparation par excision nucléotidique (NER) est un important système de réparation par excision de l'ADN dans les cellules. Il est capable de réparer et de remplacer des régions endommagées jusqu'à 30 bases de longueur et il est dirigé par le brin de gabarit intact. Les dommages à l'ADN courants sont dus au rayonnement ultraviolet et le NER protège l'ADN en réparant ces dommages immédiatement avant de devenir des mutations et de passer dans les générations futures ou de provoquer des maladies. Le NER fournit spécifiquement une protection contre les mutations causées indirectement par des facteurs exogènes tels que les cancérogènes environnementaux et chimiques. Le NER est observé dans presque tous les organismes et reconnaît les dommages qui provoquent une distorsion significative de l'hélice d'ADN.
Le processus NER implique l'action de nombreuses protéines telles que XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, etc. et se déroule via plusieurs mécanismes de type couper-coller. Ces protéines sont essentielles à l'achèvement du processus de réparation, et un défaut dans l'une des protéines NER est vital et peut provoquer de rares syndromes récessifs: xeroderma pigmentosum (XP), syndrome de Cockayne (CS) et la forme photosensible du trouble des cheveux cassants trichothiodystrophie (TTD).
Figure 02: Réparation par excision de nucléotides
Quelle est la différence entre la réparation par excision de base et la réparation par excision nucléotidique?
Diff article au milieu avant la table
Réparation par excision de base vs réparation par excision de nucléotides |
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| La réparation par excision de base (BER) est un système de réparation de l'ADN qui se produit dans les cellules. | La réparation par excision nucléotidique (NER) est un autre type de système de réparation de l'ADN trouvé dans les cellules. |
| Reconnaître les adduits à l'ADN | |
| Le BER répare les dommages aux petits adduits d'ADN. | Le NER répare les gros adduits d'ADN. |
| Dommages à l'ADN | |
| BER reconnaît les dommages qui ne provoquent pas de distorsions significatives de l'hélice d'ADN. | Le NER reconnaît les dommages qui provoquent des distorsions importantes de l'hélice d'ADN. |
| Causes des dommages à l'ADN | |
| BER répare les dommages causés par les mutagènes endogènes. | Le NER répare les dommages causés par des mutagènes exogènes. |
| Complexité | |
| BER est le système de réparation le moins complexe | C'est plus complexe que BER. |
| Besoin de protéines | |
| BER ne nécessite pas d'autres protéines. | Le NER nécessite plusieurs produits géniques, en particulier des protéines, pour distinguer les régions endommagées et non endommagées. |
| Pertinence | |
| BER convient pour corriger les dommages sur une seule base. | NER convient pour remplacer les régions endommagées. |
Résumé - Réparation par excision de base vs réparation par excision de nucléotides
NER et BER sont deux types de processus de réparation par excision de l'ADN trouvés dans les cellules. BER est capable de réparer de petits dommages causés de manière endogène tandis que le NER est capable de réparer des régions endommagées jusqu'à 30 paires de bases de longueur causées principalement de manière exogène. BER diffère du NER dans les types de substrats reconnus et dans l'événement de clivage initial. Le BER peut également reconnaître des dommages qui n'ont pas été causés par des distorsions significatives dans l'hélice d'ADN tandis que le NER reconnaît des distorsions significatives de l'hélice d'ADN. C'est la différence entre la réparation par excision de base et l'excision de nucléotides.
Courtoisie d'image:
1. «Excersion de la base de réparation de l'ADN en» Par LadyofHats - (Domaine public) via Wikimedia Commons
2. «Une représentation schématique de modèles pour la voie de réparation par excision des nucléotides contrôlée par les protéines Uvr» Par Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui et Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) via Commons Wikimedia
