Différence clé - CRISPR vs ARNi
L'édition du génome et la modification du gène sont des domaines d'intérêt à venir en génétique et en biologie moléculaire. La modification génique est largement applicable aux études de thérapie génique et est également utilisée pour identifier les propriétés du gène, la fonctionnalité du gène et comment les mutations du gène pourraient affecter sa fonction. Il est important de développer des moyens efficaces et fiables pour apporter des modifications précises et ciblées au génome des cellules vivantes. Des techniques telles que CRISPR et RNAi sont utilisées pour modifier les gènes avec une grande précision. CRISPR ou répétitions palindromiques courtes régulièrement espacées en grappes est un mécanisme de défense immunitaire procaryote naturel qui a été récemment utilisé pour l'édition et la modification de gènes eucaryotes. L'interférence ARNi ou ARN est une méthode spécifique à une séquence pour faire taire les gènes en introduisant de petits ARN double brin qui interviennent avec les acides nucléiques et régulent l'expression des gènes. C'est la principale différence entre CRISPR et RNAi.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que CRISPR
3. Qu'est-ce que l'ARNi
4. Similitudes entre CRISPR et RNAi
5. Comparaison côte à côte - CRISPR vs RNAi sous forme tabulaire
6. Résumé
Qu'est-ce que CRISPR?
Le système CRISPR est un mécanisme naturel présent dans certaines bactéries dont E. coli et archea. C'est une protection immunitaire adaptative contre les invasions à base d'ADN étranger. C'est un mécanisme spécifique à la séquence. Le système CRISPR contient plusieurs éléments de répétition d'ADN. Ces éléments sont entrecoupés de courtes séquences «espaceurs» dérivées d'ADN étranger et de plusieurs gènes Cas. Certains des gènes Cas sont des nucléases. Ainsi, le système immunitaire complet est appelé système CRISPR / Cas.
Figure 01: Système CRISPR / Cas
Le système CRISPR / Cas fonctionne en quatre étapes.
- Le système attache génétiquement des segments d'ADN de phages et de plasmides envahissants (espaceurs) dans des locus CRISPR (appelée étape d'acquisition d'espaceurs).
- Étape de maturation de l'ARNr - L'hôte transcrit et traite les locus CRISPR pour générer de l'ARN CRISPR mature (ARNr cr) contenant à la fois les éléments de répétition CRISPR et les éléments d'espacement intégrés.
- Détection de l'ARNr - Ceci est facilité par l'appariement de bases complémentaires. Ceci est important lorsqu'une infection est présente et qu'un agent infectieux est présent.
- Étape d'interférence cible - l'ARNr détecte l'ADN étranger, forme un complexe avec l'ADN étranger et protège l'hôte contre l'ADN étranger.
À l'heure actuelle, le système CRISPR / Cas est utilisé pour altérer ou modifier le génome des mammifères par répression ou activation de la transcription. Les cellules de mammifères peuvent répondre aux cassures d'ADN médiées par CRISPR / Cas9 en adoptant un mécanisme de réparation. Elle peut être effectuée soit en utilisant la méthode de jonction d'extrémité non homologue (NHEJ) ou la réparation dirigée par homologie (HDR). Ces deux mécanismes de réparation ont lieu en introduisant des cassures double brin. Il en résulte une modification du gène mammifère. Ainsi, à l'heure actuelle, le système CRISPR / Cas est utilisé dans les domaines des applications thérapeutiques, biomédicales, agricoles et de recherche.
Qu'est-ce que l'ARNi?
L'interférence ARN est une technique médiée par ARN double brin, qui est utilisée pour réguler l'expression génique. Le principal composé impliqué est les petits ARN interférents (siARN). Les siARN sont un type spécial d'ARN double brin avec un surplomb 3 'de deux nucléotides et un groupe phosphate 5'. Le complexe de silençage induit par l'ARN (RISC) est formé lors de l'interférence ARN qui entraînerait la dégradation du gène lié au siRNA.
Figure 02: ARNi
La procédure de l'ARNi est la suivante.
- L'ARN double brin sera traité dans le cytoplasme par une endoribonucléase de type RNase III appelée Dicer pour générer des siRNA longs d'environ 21 nucléotides
- Transfert de Dicer lié à l'ARNsi à Argonaute, à l'aide de protéines de liaison à l'ARN double brin (dsRNABP).
- Liaison d'Argonaute à un brin du duplex (brin guide). Cela déplacera l'autre volet. Il en résulte un complexe protéine-ARN complet appelé RISC.
- L'appariement du complexe RISC avec l'ARN guide simple brin lié à l'Argonaute.
- L'appariement de la cible ARN homologue avec l'ARN guide.
- Activation d'Argonaute entraînant la dégradation de l'ARN cible
Quelle est la similitude entre CRISPR et RNAi?
Les deux sont utilisés comme outils de recherche modifiant l'expression génique
Quelle est la différence entre CRISPR et RNAi?
Diff article au milieu avant la table
CRISPR vs ARNi |
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| CRISPR est un mécanisme de défense immunitaire qui a été récemment utilisé pour l'édition et la modification de gènes eucaryotes. | L'ARNi est une méthode spécifique à une séquence pour faire taire les gènes en introduisant de petits |
| Séquence de ciblage | |
| L'ARN synthétique (ARN guide) est la séquence de ciblage de CRISPR. | l'ARNsi est la séquence de ciblage de l'ARNi. |
| Efficacité de la suppression génique | |
| Faible en CRISPR | Riche en ARNi |
| Effets | |
| Le knockdown des gènes se produit dans CRISPR. | Knockout / silencing se produit dans l'ARNi. |
Résumé - CRISPR vs RNAi
CRISPR ou répétitions palindromiques courtes régulièrement espacées en grappes est un mécanisme de défense immunitaire procaryote naturel qui a été récemment utilisé pour l'édition et la modification de gènes eucaryotes. L'interférence ARNi ou ARN est une méthode spécifique à une séquence pour faire taire les gènes en introduisant de petits ARN double brin qui interviennent avec les acides nucléiques et régulent l'expression des gènes. Cela peut être considéré comme la différence fondamentale entre CRISPR et RNAi. Les deux techniques, CRISPR / Cas et RNAi, sont des outils puissants pour les manipulations de gènes, bien que CRISPR / Cas soit certainement plus supérieur à l'ARNi car il peut être utilisé pour induire à la fois des insertions et des délétions. La spécificité est également élevée dans le système CRISPR / Cas.
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