Le différence clé entre la séquence conservée et la séquence consensus est que la séquence conservée fait référence à des séquences similaires d'acides nucléiques ou d'acides aminés qui se produisent dans des espèces différentes ou identiques au fil des générations, tandis que la séquence consensus est une séquence de nucléotides ou une séquence d'acides aminés couramment rencontrée dans une région hautement conservée d'ADN ou d'ARN ou de protéine.
Les organismes partagent des caractéristiques similaires et différentes. Lors de l'étude des relations entre les organismes et de leur classification, le génome ou la constitution génétique des organismes est très important. Certaines séquences de nucléotides ou d'acides aminés sont communes à différents organismes. Une séquence conservée est une séquence d'acide nucléique ou d'acides aminés qui est cohérente entre les espèces. Par conséquent, ils sont phylogénétiquement importants lors de la génération d'arbres phylogénétiques. Dans les séquences conservées, il existe des séquences nucléotidiques spécifiques qui sont plus couramment trouvées. Ils sont connus sous le nom de séquences consensus.