La principale différence entre knock in et knockout repose sur la méthode utilisée pour créer un organisme transgénique. Dans le knock-in de gène, l'insertion d'un nouveau gène a lieu tandis que dans le knock-out de gène, le retrait d'un gène existant a lieu pour créer un organisme transgénique.
Les organismes transgéniques sont des organismes dont la constitution génétique est modifiée. «Organismes recombinants» en est un synonyme. Dans la plupart des cas, les organismes transgéniques contiennent des caractéristiques bénéfiques. Lors de la création d'organismes transgéniques, les gènes deviennent la cible. Selon le besoin, un gène peut être introduit ou retiré. Gene knock in se réfère à l'introduction d'un nouveau gène tandis que knockout se réfère à l'élimination d'un gène.
