Différence clé - VNTR vs STR
Les études ADN ont une immense utilité pour comprendre et déterminer les relations phylogénétiques, diagnostiquer les maladies génétiques et cartographier les génomes des organismes. Plusieurs techniques associées à l'analyse d'ADN sont utilisées pour l'identification d'un gène particulier ou d'une séquence d'ADN dans un pool d'ADN inconnu. Ils sont connus comme des marqueurs génétiques. Les marqueurs génétiques sont utilisés en biologie moléculaire pour identifier les variations génétiques entre les individus et les espèces. La répétition en tandem à nombre variable (VNTR) et la répétition en tandem courte (STR) sont deux types de marqueurs génétiques qui montrent un polymorphisme chez les individus. Les deux types sont des ADN répétitifs non codants qui sont des répétitions en tandem. Ils sont disposés en tête à queue dans les chromosomes. VNTR est une section du génome où une courte séquence nucléotidique est répétée plusieurs fois. STR est une autre section d'ADN dans le génome qui est organisée en unités répétitives constituées de deux à treize nucléotides en cent fois. La principale différence entre VNTR et STR est le nombre de nucléotides dans une séquence répétée. Les unités répétitives de VNTR se composent de 10 à 100 nucléotides tandis que les unités répétitives de STR se composent de 2 à 13 nucléotides. VNTR et STR sont largement utilisés dans les études médico-légales.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que VNTR
3. Qu'est-ce que STR
4. Similitudes entre VNTR et STR
5. Comparaison côte à côte - VNTR vs STR sous forme tabulaire
6. Résumé
Qu'est-ce que VNTR?
Une répétition en tandem est une courte séquence d'ADN qui est répétée tête-bêche à un locus chromosomique spécifique. Il n'y a pas d'autre séquence ou nucléotide dans la répétition en tandem. Il existe plusieurs types de répétitions en tandem dans le génome. VNTR est un type de répétition en tandem parmi eux qui a des unités répétitives constituées de 10 à 100 nucléotides. VNTR est un type de minisatellite. Ces répétitions en tandem peuvent être trouvées dans de nombreux chromosomes. Ils sont intercalés dans le génome humain et se situent principalement dans les régions subtélomériques des chromosomes.
Les VNTR montrent un polymorphisme répété en tandem chez les individus. La longueur du VNTR à un emplacement particulier du chromosome est très variable entre les individus en raison de la variation du nombre d'unités répétitives organisées dans cette section d'ADN. Par conséquent, le VNTR peut être utilisé comme un outil puissant dans l'identification des individus et l'analyse VNTR est utilisée dans de nombreux domaines, notamment la génétique, la recherche en biologie, la criminalistique et l'empreinte digitale d'ADN. Les VNTR ont été les premiers marqueurs génétiques utilisés pour quantifier la greffe de moelle osseuse. Les VNTR ont également été les premiers marqueurs polymorphes utilisés dans le profilage de l'ADN en criminalistique.
Figure 01: Variation des VNTR chez six individus
L'analyse VNTR est effectuée via un polymorphisme de longueur de fragment de restriction suivi d'une hybridation Southern. Par conséquent, il a besoin d'un échantillon d'ADN relativement important. L'interprétation du profil VNTR est également problématique. En raison de ces limitations, l'utilisation du VNTR en génétique médico-légale a été limitée et elle est remplacée par l'analyse STR.
Qu'est-ce que STR?
STR est une section d'ADN hautement répétitive qui se compose de deux à treize unités répétitives nucléotidiques organisées en tandem. STR est similaire à VNTR. Mais cela varie de VNTR du nombre de nucléotides dans une séquence répétée et du nombre de répétitions. STR est un type de microsatellite.
Analyse STR impliquée dans la mesure du nombre exact d'unités répétitives. Les DOS sont très variables selon les individus, comme les VNT. Les profils STR diffèrent d'une personne à l'autre. Par conséquent, l'analyse STR est utilisée en biologie moléculaire pour comparer des locus spécifiques sur l'ADN de deux échantillons ou plus. Les STR sont donc considérés comme de puissants marqueurs génétiques en biologie moléculaire. Il constitue un excellent outil pour l'identification des individus en raison de leur degré élevé de polymorphisme et de leur longueur relativement courte.
À l'heure actuelle, les STR sont l'outil de polymorphisme génétique analysé le plus couramment utilisé en génétique médico-légale. La plupart des dossiers médico-légaux impliquent une analyse polymorphe STR. Les loci STR sont disséminés dans tout le génome. Il y a des milliers de STR situés dans les chromosomes qui peuvent être utilisés dans l'analyse médico-légale. L'analyse STR n'implique pas de polymorphisme de longueur de restriction comme l'analyse VNTR. L'analyse STR ne coupe pas l'ADN avec des enzymes de restriction. Des sondes spécifiques sont utilisées pour attacher les régions souhaitées sur l'ADN et en utilisant la technique de PCR, les longueurs de la STR sont déterminées.
Figure 02: Variation STR entre les échantillons
Quelles sont les similitudes entre VNTR et STR?
- VNTR et STR sont de l'ADN non codant.
- Les deux sont des répétitions en tandem.
- Les deux montrent un polymorphisme chez les individus en raison de la différence de longueur de la section d'ADN.
- Les deux sont utilisés comme marqueurs génétiques puissants dans l'empreinte digitale d'ADN et dans les études médico-légales.
Quelle est la différence entre VNTR et STR?
Diff article au milieu avant la table
VNTR vs STR |
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| Le VNTR est un ADN répétitif non codant qui a une courte séquence nucléotidique répétée en tandem. | STR est une section d'ADN hautement répétitive qui se compose de deux à treize unités répétitives nucléotidiques organisées en tandem. |
| Taille | |
| Les VNTR sont plus grands que les STR. | Les STR sont plus petits que les VNTR. |
| Nombre de nucléotides dans la séquence répétée | |
| L'unité répétitive de VNTR se compose de 10 à 100 nucléotides. | L'unité répétitive de STR se compose de 2 à 13 nucléotides. |
Résumé - VNTR vs STR
VNTR et STR sont deux marqueurs génétiques puissants utilisés en biologie moléculaire, en particulier dans le domaine de la génétique médico-légale. VNTR est un type de minisatellite et STR est un microsatellite. VNTR et STR sont des ADN non codants et hautement répétitifs. Ce sont des répétitions en tandem. La structure générale de VNTR et STR est la même. Cependant, le nombre de nucléotides dans la séquence répétitive et la longueur sont différents. VNTR a des séquences répétitives composées de 10 à 100 nucléotides. STR a des séquences répétitives constituées de 2 à 13 nucléotides. C'est la différence entre VNTR et STR.
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