La principale différence entre la dyskinésie tardive et la dystonie est que la dyskinésie tardive est toujours secondaire à l'utilisation à long terme de neuroleptiques, mais la dystonie peut être due à diverses autres causes. De plus, la dystonie est le tonus musculaire anormal entraînant des spasmes musculaires ou des postures anormales. Alors que la dyskinésie tardive se réfère à des grimaces incontrôlables de bouche et de claquement de lèvres qui se développent après l'utilisation à long terme de neuroleptiques.
Ces deux conditions sont des troubles anormaux du mouvement; les dystonies comprennent une variété de troubles du mouvement qui surviennent pour diverses raisons, tandis que la dyskinésie tardive n'est qu'un sous-groupe des dystonies primaires.