La principale différence entre motif et domaine est que le motif n'est pas indépendamment stable tandis que le domaine est indépendamment stable.
Les protéines sont des macromolécules biologiques importantes présentes dans notre corps. D'autre part, le code génétique d'un gène décidera de la séquence d'acides aminés d'une protéine. De plus, les protéines ont des structures primaires, secondaires et tertiaires. La structure primaire est la séquence d'acides aminés de la chaîne polypeptidique. Lorsque les chaînes polypeptidiques se replient les unes avec les autres, elles forment la structure secondaire de la protéine. Les hélices alpha, les feuillets bêta et les structures super-secondaires appartiennent aux structures secondaires. Certains groupements d'éléments super-secondaires sont connus sous le nom de motifs protéiques. La structure tertiaire d'une protéine fait référence à sa structure tridimensionnelle qui décide de la fonction de la protéine. Le domaine est une section pliée d'une molécule de protéine, qui est globulaire et a une fonction discrète. C'est la structure fonctionnelle et tridimensionnelle fondamentale de la protéine.