Différence clé - RNASE A vs RNASE H
Les ribonucléases sont des nucléases qui dégradent spécifiquement l'ARN en unités plus petites. Ils peuvent être divisés en deux catégories; endoribonucléases et exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui peut dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Il clive les liaisons phosphodiester au sein d'une chaîne polynucléotidique ARN. Les exemples sont la RNase A, la RNase III, la RNase T1, la RNase P et la RNase H. L'exoribonucléase est une exonucléase qui a dégradé l'ARN en éliminant les nucléotides terminaux de l'extrémité 5 'ou 3' de la molécule d'ARN. Les exemples sont la RNase R, la RNase II, la RNase D et la RNase PH. La principale différence entre la RNASE A et la RNASE H est que la RNase A est une ribonucléase pancréatique qui dégrade spécifiquement l'ARN simple brin en composants plus petits tandis que la RNase H est une enzyme non spécifique qui clive l'ARN de l'hybride ARN-ADN en unités plus petites via le mécanisme hydrolytique.
CONTENU
1. Aperçu et différence clé
2. Qu'est-ce que RNASE A
3. Qu'est-ce que RNASE H
4. Similitudes entre RNASE A et RNASE H
5. Comparaison côte à côte - RNASE A vs RNASE H sous forme tabulaire
6. Résumé
Qu'est-ce que la RNASE A?
La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement les résidus cytosine et uracile non appariés à l'extrémité 3 'de l'ARN simple brin. La RNase H fonctionne à une concentration de sel plus élevée (concentration de NaCl 0,3 M ou plus). La réaction hydrolytique se déroule en deux étapes. Il forme un produit phosphorylé 3 'via l'intermédiaire monophosphate cyclique 2', 3 '. Bien qu'il soit spécifique de l'ARN simple brin à une concentration de sel plus élevée, il peut également dégrader l'ARN et l'ARN double brin dans l'hybride ARN-ADN à une concentration de NaCl inférieure (inférieure à 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield a d'abord synthétisé cette enzyme. La RNase A est une enzyme très populaire dans la recherche moléculaire. La RNase A pancréatique bovine est un exemple de RNase A. Et c'est l'une des enzymes les plus résistantes utilisées en laboratoire. Cette enzyme n'a pas besoin d'un cofacteur pour son activité. C'est une enzyme hautement thermostable. La RNase A est la première enzyme et la troisième protéine pour lesquelles une séquence correcte d'acides aminés a été détectée. Cette enzyme est très petite avec 124 acides aminés et une masse moléculaire de 12600da. Et il a quatre résidus histidine (His 12 et His 119 qui impliquent une réaction catalytique).
Figure 01: La RNase A
La RNase A peut être isolée en faisant bouillir un échantillon brut. À ébullition, toutes les autres enzymes dégradent la RNase A. La RNase A est une enzyme étonnamment stable. Cette enzyme inhibe avec la protéine inhibitrice de la ribonucléase, les complexes de métaux lourds et de vanadate d'uridine.
Qu'est-ce que la RNase H?
La RNase H est une enzyme ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN dans un hybride ARN-ADN via une réaction hydrolytique. La RNase H clive la liaison 3'- OP de l'ARN dans un hybride ARN-ADN. Finalement, il produit des produits à terminaison phosphate 3'OH et 5 '. Dans la réplication de l'ADN, il joue un rôle central en éliminant l'amorce d'ARN après la formation de nouveaux brins d'ADN. Dans des conditions de laboratoire, il dégrade spécifiquement l'ARN dans l'hybride ARN-ADN mais pas l'ADN et l'ARN non hybridé. Et cette enzyme est généralement utilisée pour détruire la matrice d'ARN après la formation du premier brin d'ADN complémentaire lors de la synthèse de l'ADNc.
Figure 02: RNase H
La RNase H est également utilisée dans les tests de protection contre la nucléase. Il peut également être incorporé à l'élimination de la queue poly A de l'ARNm. La RNase H a la capacité de détruire l'ARN non codant à l'intérieur et à l'extérieur de la cellule. Les ions métalliques sont nécessaires comme cofacteurs pour cette activité protéique. Un chélateur (EDTA) peut être utilisé pour inhiber l'enzyme RNase H.
Quelles sont les similitudes entre RNASE A et RNASE H?
- Les deux sont de nature protéique.
- Les deux sont endoribonucléase
- Les deux peuvent dégrader l'ARN.
- Les deux effectuent des réactions hydrolytiques.
- Les laboratoires moléculaires utilisent les deux.
Quelle est la différence entre RNASE A et RNASE H?
Diff article au milieu avant la table
RNASE A vs RNASE H |
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| La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement l'extrémité 3 'des résidus cytosine et uracile non appariés d'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. | La RNase H est une enzyme ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN en hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. |
| Nature du clivage de l'ARN | |
| La RNase A clive spécifiquement l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. | La RNase H clive l'ARN dans un hybride ARN-ADN. |
| Besoin de cofacteurs pour l'activité | |
| La RNase A n'a pas besoin de cofacteurs pour son activité. | La RNase H a besoin d'ions métalliques comme cofacteurs pour son activité. |
| Inhibiteurs de l'activité des protéines | |
| La protéine inhibitrice de la ribonucléase, les complexes de métaux lourds et de vanadate d'uridine inhibent l'activité de l'ARNase A. | Un chélateur (EDTA) inhibe l'activité RNase H. |
| Élimination de l'amorce d'ARN dans la réplication de l'ADN | |
| La RNase A n'est pas utilisée pour l'élimination des amorces d'ARN dans la réplication de l'ADN. | La RNase H est utilisée pour l'élimination des amorces d'ARN dans la réplication de l'ADN |
| Suppression du modèle d'ADN dans la synthèse d'ADN complémentaire (ADN C) | |
| La RNase A n'est pas utilisée pour l'élimination de la matrice d'ARN pendant la synthèse d'ADN complémentaire (ADN C). | La RNase H est utilisée pour l'élimination de la matrice d'ARN pendant la synthèse d'ADN complémentaire (ADN C). |
| Suppression de Poly-A-Tail dans l'ARNm hybridé à Oligo (dt) | |
| La RNase A n'est pas utilisée pour éliminer la «queue poly-A» dans l'ARNm hybridé à l'oligo (dt). | La RNase H est utilisée pour éliminer la «queue poly-A» de l'ARNm hybridé à l'oligo (dt) |
Résumé - RNASE A vs RNASE H
Les ribonucléases sont des enzymes nucléases qui ont la capacité de cliver l'ARN en unités plus petites. Ce sont deux types; endoribonucléases et exoribonucléases. L'endoribonucléase est une endonucléase qui a la capacité de dégrader l'ARN simple brin ou double brin. Et il clive la liaison phosphodiester au sein d'une chaîne polynucléotidique ARN. La RNase A et la RNase H sont deux endoribonucléases. La RNase A est une ribonucléase pancréatique qui clive spécifiquement les résidus cytosine et uracile non appariés à l'extrémité 3 'de l'ARN simple brin à une concentration en sel plus élevée. La RNase H est une enzyme ribonucléase non spécifique qui peut dégrader l'ARN en hybride ARN-ADN par réaction hydrolytique. C'est la différence entre la RNase A et la RNase H.
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