La principale différence entre l'endogroupe et l'exogroupe en biologie est qu'un endogroupe est un groupe de taxons étroitement apparentés qui est étudié pour des relations évolutives tandis que l'exogroupe est un groupe de référence ou un taxon en dehors du groupe d'intérêt et plus éloigné lié à l'endogroupe.
La cladistique ou phylogénétique est la méthode la plus couramment utilisée dans la classification biologique. Il utilise l'ancêtre commun le plus récent pour classer les organismes en groupes ou clades. L'analyse cladistique produit enfin un cladogramme, qui est un diagramme en forme d'arbre représentant les relations phylogénétiques entre les organismes. Ainsi, la cladistique aide à déterminer les relations évolutives entre les espèces, en particulier les organismes monophylétiques. L'exogroupe et l'endogroupe sont deux groupes définis en cladistique. L'endogroupe est le groupe de taxons qui est étudié pour déterminer les relations évolutives. Ce sont des taxons étroitement apparentés ou des taxons frères. En revanche, un outgroup est un groupe de référence qui est en dehors du groupe d'intérêt. L'exogroupe est éloigné de l'endogroupe.
