Transposon vs rétrotransposon
Les transposons et les rétrotransposons sont des composants génétiques de l'ADN, et il existe des différences majeures entre eux. Le pourcentage de présence de ces matériaux génétiques varie selon les espèces et leurs fonctions déterminent le sort de l'organisme avec des mutations et d'autres changements phénotypiquement importants. Les transposons et les rétrotransposons sont des gènes ou des collections de certains gènes situés dans les brins d'ADN, et les altérations de leurs emplacements ont été les principales causes de ces conséquences. Cependant, cet article se propose de discuter brièvement des fonctions de ces gènes et présente une comparaison entre transposons et rétrotransposons.
Qu'est-ce que le transposon?
Les transposons sont des fragments ou segments d'ADN intéressants avec la capacité de changer l'emplacement du brin d'ADN sous la forme d'un mécanisme couper-coller. En raison de cette nature mobile des transposons, ceux-ci sont connus sous le nom de gènes sautants. Les transposons sont de deux types principaux connus sous le nom de transposons de classe I et de transposons de classe II. Habituellement, le type de classe II est appelé transposons et le type de classe I est appelé rétrotransposons. Les processus de découpage et de collage de segments d'ADN mobiles sont régulés par l'enzyme transposase. L'enzyme se lie aux deux extrémités du transposon et coupe les liaisons phosphodiester du brin d'ADN, isole le transposon, le déplace vers le site cible et se lie au nouvel emplacement. Cependant, ce processus est intéressant à comprendre,car certains transposons ne peuvent se déplacer que vers certains emplacements uniquement en raison de l'incompatibilité des séquences de base avec le site cible. Les gènes avec une extrémité d'un seul brin ont la même séquence de bases avec l'autre extrémité de l'autre simple brin sont des transposons avec des bords collants, car ceux-ci peuvent se lier aux sites du brin d'ADN cible avec la même séquence de bases que dans les extrémités collantes. Cependant, cette mobilité des gènes peut entraîner des modifications du génotype ainsi que du phénotype de l'organisme. Les scientifiques ont inventé les transposons et les aliments et organismes génétiquement modifiés selon les personnalisations préférées ont ensuite été mis à disposition. Cultures agricoles très productives, antibiotiques aux propriétés médicinales,Les animaux d'élevage faisaient partie des produits avantageusement développés après l'invention des transposons par Barbara McClintock dans les années 1940.
Qu'est-ce que le rétrotransposon?
Les rétrotransposons sont les transposons de classe I, et ceux-ci se déplacent à travers le génome par le mécanisme du copier-coller. Le mécanisme de la mobilité des rétrotransposons implique quelques étapes majeures telles que la copie du segment génique du brin d'ADN dans l'ARN, le transfert de la copie de l'ARN vers le site cible, la transcription de la séquence d'ARN en ADN à l'aide de la transcriptase inverse et l'insertion du gène dans le nouvel emplacement du brin d'ADN du génome. Les deux extrémités de ces rétrotransposons ont généralement de longues répétitions terminales avec environ 1000 paires de bases, et celles-ci sont utilisées comme caractéristiques d'identification de ces gènes. Ces gènes sont facilement amplifiés à l'intérieur du génome et le pourcentage de rétrotransposons dans le génome humain est d'environ 50%. Ceux-ci pourraient être très dangereux car le virus causal du sida, du VIH,et le virus de la leucémie à cellules T ont les rétrotransposons dans leurs génomes d'ARN. En fait, ces virus peuvent se lier aux rétrotransposons dans n'importe quel site des brins d'ADN humain avec l'utilisation de la transcriptase inverse et de l'intégrase. L'enzyme intégrase fonctionne de la même manière que la transposase dans les transposons de classe II.
Quelle est la différence entre le transposon et le rétrotransposon?
• Les transposons sont des gènes sautants de classe II tandis que les rétrotransposons entrent dans la catégorie de classe I.
• Les transposons fonctionnent avec l'enzyme transposase tandis que les rétrotransposons fonctionnent avec l'utilisation de deux enzymes principales appelées transcriptase inverse et intégrase.
• Les extrémités terminales sont beaucoup plus longues dans les rétrotransposons que dans les transposons.
• Les transposons sont coupés à l'origine et collés sur la cible; inversement, les rétrotransposons étant copiés de l'origine en ARN et transcrits au niveau de la cible.
• Le déplacement des rétrotransposons implique l'ARN mais pas dans les transposons.
