Agarose vs polyacrylamide
L'agarose et le polyacrylamide sont tous deux des polymères hydrosolubles mais, entre eux, de nombreuses différences peuvent être observées, à partir de leur origine. L'agarose et le polyacrylamide ont quelque chose de commun dans leur capacité à former des matrices de gel poreuses. Malgré cela, il existe un certain nombre de différences distinctes entre les deux. Les différences majeures entre ces deux polymères résident dans leur nature d'origine, leur structure chimique, leurs différentes utilisations et leurs performances en termes d'électrophorèse sur gel.
Qu'est-ce que l'agarose?
L'agarose est un polymère linéaire naturel qui est à son tour dérivé d'un polymère complexe appelé agar trouvé dans les algues. L'agarose est extrait de l'agar par l'élimination de son composant protéique appelé agaropectine. L'agarose est ce qui donne à l'agar sa capacité à former des gels.
L'agarose est principalement utilisé dans les études microbiologiques et biologiques moléculaires. Dans les études microbiologiques, l'agarose, lorsqu'il est complété par des nutriments appropriés, fournit une base solide pour la culture de micro-organismes tels que les bactéries et les champignons. Lorsqu'il est utilisé à des concentrations semi-solides, il peut être utile pour évaluer la motilité de ces micro-organismes. En biologie moléculaire, il sert d'outil important pour l'un des processus de résolution les plus fondamentaux appelés «électrophorèse sur gel» ou «électrophorèse sur gel d'agarose» (AGE). L'électrophorèse sur gel est un processus qui permet la résolution ou la séparation d'acides nucléiques ou de protéines en fonction de leur taille et de leur charge. Ici, l'agarose sert de gel poreux en forme de tamis à travers lequel la séparation se produit.
Structure de l'agarose
Qu'est-ce que le polyacrylamide?
Le polyacrylamide est un polymère synthétique et est utilisé dans une grande variété d'industries. Comme mentionné précédemment, son utilisation repose sur sa capacité à former des gels. Cependant, en plus de cela, sa capacité à retenir et à drainer l'eau à différentes concentrations est également exploitée dans diverses industries.
L'utilisation la plus répandue et la plus courante du polyacrylamide est le traitement des eaux usées. Ici, il est utilisé comme agent floculant pour éliminer toute matière organique en suspension; par conséquent, améliorer la turbidité et clarifier l'eau. Une autre utilisation du polyacrylamide est dans l'industrie du papier. Ici, il est utilisé pour retenir ou drainer l'eau de la pâte à papier selon les besoins. De même, dans les industries de l'agriculture et de la construction, il est utilisé comme conditionneur de sol pour prévenir l'érosion du sol et améliorer sa qualité.
Comme l'agarose, le polyacrylamide est également utilisé en biologie moléculaire comme un outil de résolution important dans un processus similaire appelé «électrophorèse sur gel de polyacrylamide» (PAGE). En plus de tout cela, le polyacrylamide est également utilisé dans le traitement du minerai et la fabrication d'agent floculant pour éliminer toute matière organique en suspension; par conséquent, améliorer la turbidité et clarifier l'eau. Une autre utilisation du polyacrylamide est dans l'industrie du papier. Ici, il est utilisé pour retenir ou drainer l'eau de la pâte à papier selon les besoins. De même, dans les industries de l'agriculture et de la construction, il est utilisé comme conditionneur de sol pour prévenir l'érosion du sol et améliorer sa qualité. En plus de tout cela, le polyacrylamide est également utilisé dans la fabrication d'additifs alimentaires, de lentilles de contact souples et de textiles.
Structure en polyacrylamide
Quelle est la différence entre l'agarose et le polyacrylamide?
Origine de l'agarose et du polyacrylamide:
Agarose: L'agarose est un polymère d'origine naturelle. Il est dérivé d'algues.
Polyacrylamide: Le polyacrylamide est d'origine synthétique et ne se trouve dans aucune circonstance naturelle.
Formule moléculaire de l'agarose et du polyacrylamide:
Agarose: La formule moléculaire de l'agarose est C 24 H 38 O 19.
Polyacrylamide: La formule moléculaire du polyacrylamide est (C 3 H 5 NO) n.
Structure chimique de l'agarose et du polyacrylamide:
Agarose: L'agarose est un polysaccharide linéaire. Il est composé de répétitions d'unités disaccharidiques appelées agrobiose maintenues ensemble par des liaisons hydrogène.
Polyacrylamide: Le polyacrylamide est un polymère réticulé chimiquement. Il est composé de monomères d'acrylamide et d'un réticulant N, N'-méthylènebisacrylamide.
Toxicité de l'agarose et du polyacrylamide:
Agarose: L'agarose et son unité monomère agrobiose sont de nature non toxique.
Polyacrylamide: L'unité monomère du polyacrylamide, l'acrylamide, est un cancérogène présumé et une neurotoxine connue, alors que sa forme polymérisée est non toxique par nature.
Caractéristiques des gels d'agarose et de polyacrylamide:
ÂGE et PAGE:
Agarose: La préparation du gel d'agarose pour l'AGE prend moins de temps, est facile et simple, et ne nécessite pas d'initiateur ou de catalyseur de polymérisation.
Polyacrylamide: La préparation du gel de polyacrylamide pour PAGE est longue et fastidieuse et nécessite également un initiateur (persulfate d'ammonium) et un catalyseur de polymérisation (N, N, N ', N'-tétraméthyléthylendiamine - TEMED).
La nature:
Les gels de polyacrylamide sont chimiquement plus stables que les gels d'agarose.
Taille des pores:
Étant donné la même concentration, les matrices de gel de polyacrylamide ont tendance à avoir des tailles de pores plus petites que celles d'une matrice de gel d'agarose.
Modification de la taille des pores:
La taille des pores des gels de polyacrylamide peut être modifiée d'une manière plus contrôlée que celle des gels d'agarose.
Résolution du pouvoir:
Les gels de polyacrylamide ont un pouvoir de résolution élevé tandis que les gels d'agarose ont un faible pouvoir de résolution.
Acide nucléique compatible:
Les gels de polyacrylamide peuvent contenir de plus grandes quantités d'acide nucléique que les gels d'agarose pour des moyens de résolution.
Images avec l'aimable autorisation: Agarose et structure du polyacrylamide via Wikicommons (domaine public)
