Le différence clé entre le zooplancton et le phytoplancton est que le zooplancton est un plancton hétérotrophique non photosynthétisant qui est soit un protozoaire soit un animal, tandis que le phytoplancton est un plancton photosynthétique autotrophique qui est soit une diatomée, des cyanobactéries ou des algues.
Les planctons sont les minuscules organismes qui vivent et flottent dans les océans, les mers ou les plans d'eau douce. La plupart d'entre eux sont microscopiques et constituent d'importantes sources de nourriture pour les gros animaux. Il existe deux principaux types de plancton, à savoir le zooplancton et le phytoplancton. Les zooplanctons sont hétérotrophes et comprennent des animaux qui ne sont pas capables de photosynthèse. D'autre part, le phytoplancton est du plancton photosynthétique, qui est autotrophe. En outre, les phytoplanctons stockent de l'énergie via la photosynthèse et le zooplancton et le nekton (animaux de grande taille qui se déplacent activement dans la colonne d'eau) se nourrissent de ceux-ci. Les humains et d'autres prédateurs se nourrissent de nekton et de certains plus gros zooplancton à grande échelle. Aussi, les activités humaines telles que la pollution de l'environnement, affectent largement négativement ce flux d'énergie qui part du phytoplancton.
