La principale différence entre la métagénomique et la métatranscriptomique repose sur le type de biomolécules étudiées dans chaque domaine. La métagénomique étudie l'ADN, ses séquences et son comportement dans les organismes, tandis que la métatranscriptomique étudie l'ADN transcrit, principalement les séquences d'ARNm et son comportement dans les organismes.
La métagénomique et la métatranscriptomique sont deux domaines qui ont gagné en popularité au fil des ans par rapport à la communauté microbienne. Ils sont importants dans les soins de santé, l'industrie et la biotechnologie agricole. La métagénomique et la métatranscriptomique permettent toutes deux l'étude d'organismes individuels dans une communauté et de leurs rôles fonctionnels bénéfiques ou nuisibles.
