La principale différence entre FISH et CGH est que FISH est une technique moléculaire qui détecte une séquence d'ADN spécifique sur un chromosome à l'aide de sondes marquées par fluorescence, tandis que CGH est une autre technique de cytogénétique moléculaire qui détecte les altérations de l'ADN génomique.
L'analyse cytogénétique joue un rôle important en médecine lors de la détection d'anomalies chromosomiques telles que les aneuploïdies, les délétions, les duplications et les réarrangements, etc. Il existe diverses méthodes cytogénétiques moléculaires pour détecter les défauts et maladies susmentionnés. Parmi eux, FISH (hybridation in situ fluorescente) et CGH (hybridation génomique comparative) sont deux techniques d'hybridation puissantes. Cependant, les deux méthodes ont des avantages et des inconvénients.