La principale différence entre la capside et le capsomère est que la capside est l'enveloppe protéique qui entoure et protège le génome viral, tandis que le capsomère est la sous-unité structurelle d'une capside virale et l'agrégation de plusieurs protomères en tant qu'unité.
Les virus sont des parasites intracellulaires. Ils sont tous infectieux et provoquent différents types de maladies chez les plantes, les animaux, les protistes, les bactéries et les champignons. Il y a deux composants principaux qui font un virus. Ce sont la coquille protéique et le génome d'acide nucléique. La coquille protéique, également connue sous le nom de capside, est composée de protéines. La fonction principale de la capside est de protéger le génome viral et d'aider au processus d'infection. Une capside est constituée de capsomères, qui sont les sous-unités structurelles et morphologiques de la capside virale. Les capsomères s'auto-assemblent bien et donnent forme à la capside virale dans chaque particule virale. Structurellement, le capsomère est une agrégation de plusieurs protomères en tant qu'unité.