La principale différence entre l'appariement de bases Watson et Crick et Hoogsteen est que l'appariement de bases de Watson et Crick est la méthode standard qui décrit la formation de paires de bases entre les purines et les pyrimidines. Pendant ce temps, l'appariement de bases de Hoogsteen est une autre manière de former des paires de bases dans lesquelles la purine prend une conformation différente par rapport à la pyrimidine.
Un nucléotide a trois composants: une base azotée, un sucre pentose et un groupe phosphate. Il existe cinq bases azotées différentes et deux sucres pentoses impliqués dans la structure de l'ADN et de l'ARN. Lorsque ces nucléotides forment une séquence nucléotidique, des bases complémentaires, que ce soit des purines ou des pyrimidines, forment des liaisons hydrogène entre elles. C'est ce qu'on appelle l'appariement de base. Par conséquent, une paire de bases est formée en joignant deux bases azotées par des liaisons hydrogène. L'appariement de bases de Watson et Crick est l'approche classique ou standard, tandis que l'appariement de bases Hoogsteen est une autre façon de former des paires de bases.
