La principale différence entre les transposons composites et non composites est que les transposons composites ont deux séquences d'insertion flanquantes tandis que les transposons non composites ont des répétitions inversées au lieu de séquences d'insertion flanquantes.
Un transposon est un fragment d'ADN qui peut se transloquer dans le génome bactérien. Ce sont des séquences d'ADN mobiles. Ils se déplacent vers de nouveaux emplacements du génome. Ces mouvements modifient la séquence du génome bactérien, entraînant des modifications importantes de l'information génétique. Ce sont les éléments génétiques transposables responsables de l'établissement de nouvelles séquences génétiques chez les bactéries. Les transposons sont également appelés gènes sautants car ces séquences sautantes peuvent bloquer la transcription des gènes et réorganiser le matériel génétique de la bactérie. De plus, ils sont responsables du mouvement de la résistance aux médicaments, des gènes de résistance aux antibiotiques entre les plasmides et les chromosomes. Il existe deux types de transposons en tant que transposons composites et non composites.