Le différence clé entre l'apomorphie et la plésiomorphie est que l'apomorphie fait référence à une caractéristique qui est unique à un clade et se trouve chez tous les descendants de ce clade particulier tandis que la plésiomorphie fait référence à une caractéristique qui est présente dans le clade mais peut ne pas être présente dans tous les membres du clade.
En phylogénétique, la cladistique est le domaine qui classe les organismes en clades ou groupes en fonction des caractéristiques héritées par les ancêtres. C'est une forme d'étude très fiable qui aide à analyser les relations évolutives et phylogénétiques. Différentes terminologies peuvent être utilisées pour décrire les caractéristiques de chaque clade telles que l'apomorphie, la plésiomorphie, l'autapomorphie, la synapomorphie et l'homoplasie, etc. Parmi elles, l'apomorphie et la plésiomorphie sont des termes relatifs. Dans ces études, les logiciels informatiques sont vraiment utiles pour étudier les caractéristiques et les caractéristiques de l'apomorphie et de la plésiomorphie.
