La principale différence entre le génome et le pool de gènes est que le génome fait référence à l'ADN entier d'un organisme, tandis que le pool de gènes se réfère à l'ensemble complet de gènes uniques d'une population de croisements.
Le gène est l'unité structurelle de base de l'hérédité. Les gènes passent du parent à la progéniture via les gamètes. En outre, ils sont présents dans le génome d'un organisme. Le génome est l'ensemble complet d'ADN d'un organisme. Le pool de gènes est également un terme similaire. Mais, il représente la collection de tous les gènes présents dans une population ou une espèce. Contrairement au génome, le pool de gènes est un mélange de gènes d'une population. En conséquence, le pool de gènes représente tous les allèles possibles présents dans cette population particulière.