La principale différence entre le séquençage hiérarchique et le séquençage des fusils de chasse du génome entier est que dans le séquençage hiérarchique des fusils de chasse, le génome est divisé en fragments plus grands avant le séquençage tandis que, dans le séquençage des fusils de chasse du génome entier, le génome entier est divisé en petits fragments pour le séquençage.
Le séquençage est une technique importante dans les processus moléculaires, en particulier dans l'identification précise des espèces. En fait, c'est la technique d'identification de l'ordre précis des nucléotides dans un gène ou un génome. Il existe de nombreuses techniques de séquençage. Certains d'entre eux incluent la méthode Maxam Gilbert, la méthode Sanger et la méthode automatisée Sanger.