La principale différence entre la variation somatique et la variation germinale est que la variation somatique est la variation génétique se produisant dans les cellules somatiques, tandis que la variation germinale est la variation génétique se produisant dans les cellules germinales telles que les œufs ou les spermatozoïdes.
La variation génétique fait référence au processus de modification du matériel génétique d'un organisme ou à la différence des séquences d'ADN entre les individus d'une population. Les séquences d'ADN sont sujettes à des changements avec le temps d'une génération à l'autre. La recombinaison génétique est l'un des principaux mécanismes à l'origine de la variation génétique. En outre, la mutation peut également entraîner une variation génétique. Génétiquement, les organismes multicellulaires possèdent deux types principaux de cellules; cellules somatiques et cellules germinales. Par conséquent, la variation génétique est de deux types; ce sont la variation somatique et la variation germinale. Si la variation génétique se produit dans les cellules somatiques, nous l'appelons une variation somatique, et si la variation génétique se produit dans les cellules germinales, nous l'appelons variation germinale. Les variations somatiques sont pour la plupart non héréditaires tandis que les variations germinales sont pour la plupart héréditaires.