Le différence clé entre l'endosymbiose et l'invagination est que l'endosymbiose est une théorie qui explique l'origine des mitochondries et des chloroplastes à l'intérieur de la cellule eucaryote, tandis que l'invagination est un processus qui explique l'origine du noyau et d'autres organites cellulaires par la formation de l'invagination à partir du plasma membrane à l'intérieur de la cellule.
Les scientifiques pensent que les cellules eucaryotes ont évolué à partir de cellules procaryotes. Ils ont développé de nombreuses théories pour expliquer comment cette évolution s'est produite. L'endosymbiose est l'une de ces théories qui explique l'origine des mitochondries et du chloroplaste à l'intérieur des cellules eucaryotes des bactéries procaryotes. Alors que l'invagination est un processus qui explique l'origine du noyau et d'autres organites liés à la membrane à l'intérieur de la cellule eucaryote.
