La principale différence entre la transformation et la transduction est que la transformation est un mécanisme qui modifie le matériel génétique des bactéries par absorption directe du matériel génétique exogène de son environnement à travers la membrane cellulaire et incorporation de celui-ci dans le génome tandis que la transduction est l'injection d'ADN étranger par un virus bactériophage dans la bactérie hôte.
La conjugaison est une méthode bien connue de recombinaison d'ADN, qui peut être trouvée chez les eucaryotes et les procaryotes. Les scientifiques ont découvert qu'il est possible de transférer l'ADN d'une cellule bactérienne à une autre par deux autres mécanismes: la transformation et la transduction. Semblable à la conjugaison, ces deux mécanismes transfèrent l'ADN dans une direction et la recombinaison se produit entre les allèles dans les régions d'ADN homologues. Les deux mécanismes transfèrent très peu d'ADN et ne transfèrent pas l'ensemble du chromosome cellulaire.
