La principale différence entre le jumelage d'embryons artificiels et le transfert nucléaire de cellules somatiques est que le jumelage d'embryons artificiels est la technique dans laquelle la division d'un ovule fécondé en deux embryons génétiquement identiques a lieu dans des conditions in vitro tandis que le transfert nucléaire de cellules somatiques est une technique dans laquelle l'insertion de un noyau de cellule somatique dans un ovule énucléé a lieu dans des conditions in vitro.
Le clonage moléculaire est une technique importante pour produire des organismes recombinants avec des caractères améliorés. Le jumelage d'embryons artificiels et le transfert nucléaire de cellules somatiques sont deux de ces techniques utilisées dans des conditions in vitro dans le but de créer des clones à des fins à la fois reproductives et thérapeutiques. Cependant, il existe une différence entre le jumelage d'embryons artificiels et le transfert nucléaire de cellules somatiques en termes de méthode de clonage.