La principale différence entre l'hybridation interspécifique et intraspécifique est que l' hybridation interspécifique se produit entre deux individus apparentés appartenant à deux espèces différentes, tandis que l'hybridation intraspécifique se produit entre deux individus génétiquement divergents de la même espèce.
L'hybridation est le processus d'accouplement ou de croisement d'individus ou de groupes génétiquement différenciés. L'objectif principal de l'hybridation est de combiner des gènes souhaitables présents dans différents organismes. De plus, l'hybridation est utilisée pour produire des descendants de reproduction pure. L'accouplement peut se faire entre deux individus de la même espèce ou entre deux individus de différentes espèces. Sur cette base, il existe deux types d'hybridation: l'hybridation intraspécifique et l'hybridation interspécifique.