La principale différence entre le cycle du carbone et le cycle du phosphore est que le cycle du carbone est le cycle biogéochimique qui décrit le mouvement du carbone à travers la lithosphère, l'hydrosphère, la biosphère et l'atmosphère. Pendant ce temps, le cycle du phosphore décrit le mouvement du phosphore à travers la lithosphère, l'hydrosphère et la biosphère.
Le carbone, l'azote et le phosphore sont trois éléments majeurs qui sont importants pour tous les êtres vivants. La circulation de ces éléments via les composants biotiques et abiotiques présents dans les écosystèmes ou l'environnement est décrite par leurs cycles biogéochimiques. Le cycle du carbone explique la circulation des éléments du carbone dans l'air, le sol et l'eau tandis que le cycle du phosphore explique le comportement du phosphore à travers le sol et les organismes vivants. L'une des différences importantes entre le cycle du carbone et le cycle du phosphore est que le carbone se déplace principalement dans l'atmosphère tandis que le phosphore n'interagit pas avec l'atmosphère.
