Le différence clé entre archenteron et blastocoel est que l'archenteron est l'intestin primaire formé pendant la gastrulation dans le zygote en développement, qui se développe plus tard dans le tube digestif, tandis que le blastocèle est une cavité interne remplie de liquide ou de jaune de la blastula formée pendant la blastulation.
La fécondation est l'événement de reproduction sexuée qui forme un zygote diploïde. Le zygote se transforme finalement en embryon. L'embryon subit des divisions mitotiques et une différenciation cellulaire, ce qui en fait un embryon multicellulaire. Morula est un stade précoce de l'embryon, qui contient 16 cellules. Morula devient la blastula au septième décolleté. Blastula contient 128 cellules. C'est une sphère creuse de cellules entourant une cavité intérieure remplie de liquide. Et cette cavité de blastula remplie de liquide est connue sous le nom de blastocèle. Blastula se replie vers l'intérieur et s'agrandit pour former une gastrula, une structure multicouche contenant des couches germinales primaires. Archenteron est l'intestin principal situé dans la gastrula. Archenteron se développe dans le tube digestif plus tard.