La principale différence entre les oomycètes et les vrais champignons est que les oomycètes ont de la cellulose, des bêta-glucanes et de l'hydroxyproline dans leur paroi cellulaire tandis que les vrais champignons ont de la chitine dans leurs parois cellulaires. Une autre différence majeure entre les oomycètes et les vrais champignons est que le thalle somatique des oomycètes est diploïde tandis que le thalle somatique des vrais champignons est haploïde.
Les oomycètes et les vrais champignons sont deux groupes d'organismes eucaryotes qui présentent une croissance filamenteuse. Ils se nourrissent également de matière en décomposition. Mais la paroi cellulaire des oomycètes est constituée de composés cellulosiques et de glycane. Ils n'ont pas de chitine. Les vrais champignons ont de la chitine dans leurs parois cellulaires.
