La principale différence entre Myxomycota et eumycota est que Myxomycota se compose de moisissures visqueuses ressemblant à des champignons qui manquent de parois cellulaires à l'état végétatif, tandis que l'eumycota se compose de véritables champignons qui sont des microorganismes hétérotrophes eucaryotes filamenteux constitués de parois cellulaires rigides.
Myxomycota et eumycota sont deux divisions majeures d'organismes. Myxomycota appartient au Kingdom Protista tandis que eumycota appartient au Kingdom Fungi. Myxomycota comprend des champignons semblables à des organismes. Ils manquent de parois cellulaires constituées de chitine à l'état végétatif. Mais l'eumycota est de vrais champignons qui ont des parois cellulaires de chitine. Les vrais champignons ont des mycéliums et ce sont des microorganismes aérobies hétérotrophes.
